Bakterie startowe to preparaty mikrobiologiczne, które wprowadza się do nowo założonego oczka lub po czyszczeniu filtra. Ich zadaniem jest szybkie zasiedlenie podłoża i wkładów filtracyjnych pożytecznymi mikroorganizmami. Bakterie te rozkładają amoniak, azotyny i inne szkodliwe związki powstające z odchodów ryb czy resztek pokarmu.
Dzięki nim równowaga biologiczna ustala się szybciej, a ryzyko mętnej lub zielonej wody spada. Stosowanie bakterii startowych skraca okres dojrzewania oczka nawet o kilka tygodni. Są to preparaty bezpieczne dla roślin i zwierząt. Regularne ich użycie wspiera stabilność całego ekosystemu wodnego.